Előadások

A Duchenne-féle Izomsorvadás (DMD) halálos gyógyíthatatlan betegség, melyet a dystrophin hiánya okoz az izomszövetekben. A fehérje legnagyobb részét (az ún. rúd régiót), éppúgy mint a közeli rokon utrophin fehérjében, spectrin repeatek alkotják (STR-ek). A jelenlegi lehetséges gyógymódok mindegyikéhez, mint az exon-kihagyás, vagy a génterápiás módszerek, szükség lehet a rúd régió módosítására, a méret csökkentése céljából elsősorban egyes STR-ek kihagyásával. Kutatásunkban bioinformatikai módszerekkel elemeztünk minden humán dystrophin (24 db) és utrophin (22 db) STR-t. Jellegzetes mintázatot találtunk a dystrophin rúd régióját alkotó STR-ek izoelektromos pont (IP) értékeiben, mely mintázat a további vizsgálatok során nagyfokú konzerváltságot mutatott az emlősökben, és bizonyos szinten minden gerincesben. Lemodelleztük a 46 STR 3 dimenziós szerkezetét és megvizsgáltuk a felszíni töltéseloszlást, mely eredmény nagyfokú egyezést mutatott a talált IP mintázattal. Végül megbecsültük a szelekciós nyomást a dystrophin különböző régióin az utrophinhoz viszonyítva, különösképpen a bázikus mintázatot kialakító STR-ekben, a D3ban, D5ben, D7ben és D10től 17ig minden STRben. Azt találtuk, hogy az itt található aminosavakon pozitív szelekciós nyomás tapasztalható a bázikus töltés felhalmozódásának irányában, ellentétben a fehérje minden egyéb régiójával. Az eredményeink segítséget jelenthetnek annak eldöntésében, hogy mely spectrin repeateket lehet módosítani, s melyeknek tulajdonítható funkció a fehérje aktin kötésében.