Tudományos Diákkör    
 
 
2023. TDK
2022. TDK
2021. TDK
2020. TDK
2019. TDK
2018. TDK
2017. TDK
2016. TDK
Felhívás
Meghívó 2016.
» Állatorvos szekciók
Állatorvos zsűri
Biológus szekció
Biológus Zsűri
Díjak
Díjazottak
2015. OTDK
2015. TDK
2014. TDK
2013. TDK
2013. Támop
2013. OTKD
2012. TDK
2012. Támop
2011. TDK
2010. TDK
2009. TDK
2009. OTDK
2008. TDK
2007. TDK
2006. TDK
2005. TDK
2004. TDK
2003. TDK
2002. TDK
Home » Archívum » 2016. TDK » Állatorvos szekciók

Szekciók

Zöld anoliszból (Anolis carolinensis) kimutatott adenovírus genetikai jellemzése
Vadász Gergő V. évfolyam
MTA Agrártudományi Kutatóközpont, Állatorvos-tudományi Intézet
Témavezetők: Dr. Benkő Mária, Tarján Zoltán László

Absztrakt:

Az adenovírusok (Family: Adenoviridae, AdV) közepes méretű, ikozaéder alakú kapsziddal rendelkező, burok nélküli, kozmopolita, dsDNS vírusok. Gazdafajaik között minden gerinces osztály képviselői megtalálhatók. Gazda-specificitásuk általában erős, ugyanakkor egy gazdát akár több AdV típus is fertőzhet. Az AdV-ok és gazdafajaik leszármazását ábrázoló törzsfák topológiája feltűnően hasonló, ami a hosszú távú koevolúció eredménye lehet. Taxonómiai szempontból az Adenoviridae család 5 nemzetséget tartalmaz. A hüllőket fertőző AdV-ok többsége Atadenovirus és feltételezzük e nemzetség pikkelyes hüllő eredetét. Az AdV-os fertőzöttség leggyakrabban tünetmentes, vagy csak enyhe felső légúti és emésztőszervi megbetegedésben nyilvánul meg. Ritkán azonban súlyos kimenetelű is lehet.

TDK munkám hüllőktől származó minták PCR-es szűrésére, valamint a kimutatott AdV-ok minél teljesebb genetikai jellemzésére irányult.

Mintáimat magyarországi eredetű, elhullott és élő állatokból származó belső szervek illetve bélsár képezték. A DNS feltárást követő szűrővizsgálatokhoz az AdV-ok DNS-függő DNS-polimeráz génjének mintegy 320 bp méretű szakaszára irányuló konszenzus, nested PCR-t alkalmaztam. A genom feltérképezéséhez néhány, általunk választott gén (IVa2, III, pVII, hexon, 100K) adott szakaszainak felerősítését kíséreltem meg a laborban már meglévő, illetve általam tervezett nemzetség-specifikus primerekkel. Ezek közül a IVa2, a pVII, a hexon és a 100K adott pozitív eredményt. Az így kapott genomiális „szigeteket” specifikus primerek és egykörös PCR-ek alkalmazásával összekötöttem, majd a nukleotid sorrendet primerséta használatával határoztam meg.

Az eddig szűrt 55 minta közül 15-nél kaptam pozitív eredményt, melyek közül 12-ben korábban már leírt szekvenciát mutattam ki. Egy zöld és egy barna anoliszból származó minta tartalmazott új AdV-t, amelyek közül a zöld anoliszból kimutatott vírus genetikai elemzését végeztem. A genom IVa2 és hexon gén közötti régiójában három különböző méretű szakaszt sikerült felerősítenem, melyek együttes mérete 14771 bp, G+C-tartalma kiegyensúlyozott (51,48%). A génbanki homológia keresés eredménye alapján a DNS-polimeráz szekvenciája legközelebbi rokonságban (57% azonosság, 72% hasonlóság aminosav szinten) a Lizard 2 AdV megfelelő szakaszával állt. A polimeráz és a hexon gének aminosav szekvenciája alapján készült törzsfa-rekonstrukciók és a maximum likelihood módszerrel készült filogenetikai elemzés szintén megerősítették az anolisz AdV Atadenovirus nemzetségbe tartozását.

Eredményeink alapján úgy gondoljuk, hogy a vizsgált AdV nem gazdaváltás következtében került az állatba, hanem jelenléte hosszú távú koevolúció eredménye, azaz „valódi” anolisz AdV-t vizsgáltam.



Előadások listája