|
||||
Home
» Archívum
» 2016. TDK
» Biológus szekció
Biológus szekcióKapitány Szilvia II. évfolyam Állatorvostudományi Egyetem, Biológiai Intézet; MTA ATK ÁOTI Témavezetők: Szabó Krisztián, Dr. Kaján Győző A közelmúlt metagenomikai kutatásai rávilágítottak, hogy a Circoviridae család a cirkuláris, replikázt kódoló, egyszálú DNS genommal rendelkező vírusoknak (circular replication associated protein-encoding single stranded DNA virus, CRESS-DNS vírus) csak egy kis szeletét alkotja. Ezen nagyon diverz vírusklád tagjait kimutatták már az egysejtűektől kezdve a növényeken és ízeltlábúakon át a gerincesekig a legkülönbözőbb eukarióta fajokból. A denevér eredetű CRESS-DNS vírusok egy része a Circoviridae család tagja, de sok, ettől nagyon távol eső vírust is leírtak már. A mi vizsgálatunk célja a denevér és denevér táplálék eredetű CRESS-DNS vírusok diverzitásának feltárása, s általuk a CRESS-DNS vírusok jelenleg bonyolultnak tűnő rendszertanának megértése volt. Legfőbb kérdésünk, hogy vajon melyek lehetnek a denevérek saját, az állatokban szaporodni képes vírusai, és melyek jutnak csupán táplálkozásuk révén a szervezetükbe? Ehhez összesen 392 db európai, afrikai, ázsiai és észak-amerikai denevér mintát dolgoztunk fel, melyek zömében guanó és bélsár eredetűek voltak. A PCR analízis során a CRESS-DNS vírusok egyik megőrzött, a vírus replikációjában szerepet játszó génjének kb. 450 bp hosszú szakaszát erősítettük fel. A vizsgált minták közül 110 db bizonyult pozitívnak a PCR eljárás során. Ezek között pedig 48 db további értékelésre alkalmas, specifikus CRESS-DNS vírus szekvenciát találtunk. A törzsfa-rekonstrukció kimutatta, hogy e minták nagy része a Circoviridae családon belül a Circovirus nemzetségbe osztályozódik; feltételezzük, hogy ezek lehetnek a denevérek saját CRESS-DNS vírusai. A minták másik nagy csoportja ugyanezen családon belül a másik, Cyclovirus nemzetségbe sorolható; feltételezzük, hogy ezek táplálék, azaz rovar eredetű vírusok, ahogy a víruscsaládtól távol eső többi minta is. Előadások listája |