Szekciók

• Alaptudományi előadások: Tolnay terem
• Alkalmazott tudományi előadások: Aula

A Flaviviridae család Flavivirus nemzetségébe sorolt nyugat-nílusi vírus (WNV) egy világszerte elterjedt zoonotikus arbovírus, melynek legalább 8 különböző genetikai leszármazási vonalát (lineage) tartják számon. Az Európában cirkuláló 1-es és 2-es lineage-ekhez egyaránt számos embereket és állatokat megbetegítő járvány kitörése köthető. Első, 2004-es magyarországi izolálása óta a lineage 2 különösen Közép-Európában vált jóval elterjedtebbé, valamint a kiemelkedően nagy 2018-as európai epidémiát is ez a lineage okozta. Természetes transzmissziós ciklusa során a WNV madarak (rezervoárok) és szúnyogok (vektorok) között cirkulál. A lovak vagy az emberek véletlenszerű fertőződéséért is szúnyogok a felelősek. A fertőzések közel 80%-a tünetmentesen zajlik, azonban az esetek 1%-ában súlyos idegrendszeri tünetek is felléphetnek. A virális nukleinsav molekuláris módszerekkel (pl.: PCR: polimeráz-láncreakció) történő kimutatása fontos szerepet tölt be az akut WNV-fertőzések laboratóriumi differenciáldiagnosztikájában. A PCR vizsgálatokhoz a legalkalmasabb klinikai mintatípusnak az alvadásában gátolt teljes vért és vizeletet tartjuk. Munkánk során a Nemzeti Népegészségügyi Központ Virális Zoonózisok Nemzeti Referencialaboratóriumában üzembe helyezett Illumina MiSeq platformra dolgoztunk ki egy a WNV új generációs teljes genom szekvenálására alkalmas protokollt. A 2015 és 2021 között Magyarországon igazoltan WNV-vel fertőződött humán betegek összesen 15 db vírusizolátumából és 15 db klinikai mintájából reverz transzkripciós (RT) real-time PCR-rel meghatároztuk azok Ct (küszöb ciklus) értékét. Ezután a vírusminták teljes genomját egylépéses RT-PCR-rel amplifikáltuk, majd agarózgél-elektroforézissel visszaellenőriztük. Végül összesen 15 db izolátumból (14 db szövetfelülúszó, 1 db egéragy homogenizátum), valamint 10 db klinikai mintából (9 db vizelet, 1 db teljes vér) sikerült kinyernünk a kórokozó genomjának egészét lefedő szekvenciaadatot. Eredményeinket maximum likelihood filogenetikai analízisnek alávetve megállapítottuk, hogy hazánkban a WNV 2-es lineage-ének a szakirodalomból ismert két nagy európai kládja (kelet-európai/orosz és közép-európai/magyar klád) és ezek számos alcsoportja jellegzetes földrajzi eloszlást követve egyaránt jelen van. A 2018-as szekvenciák nem képeznek önálló filogenetikai egységet, tehát az esetszámok hirtelen megugrását ebben az évben nem egy új vírusvariáns, hanem valószínűleg a vírustranszmissziónak kedvező környezeti tényezők okozták. A 2018-as európai WNV-járvány fényében az Európai Betegségmegelőzési és Járványvédelmi Központ egy országokon átívelő, szekvenciatipizáláson alapuló járványügyi surveillance rendszer kialakítását szorgalmazza. A teljes vér mellett a vizeletminták vétele is nagyban segítheti a vírus izolálását, a virális RNS kimutatását és molekuláris tipizálását.