Tudományos Diákkör    
 
 
Felhívás
Meghívó 2024.
Állatorvos szekciók
TDK zsűri
» Biológus szekció
Díjak
Díjazottak
Fényképalbumok
Archívum
Szabályzat
Home » Biológus szekció

Zoológus/Biológus szekció

Egyes DNS vírusok monitorozása Budapest környéki béka populációkban
Fülei Zsombor Nimród III. évfolyam
Állatorvostudományi Egyetem, Zoológiai Tanszék
Témavezetők: Dr. Papp Tibor, Dr. Herczeg Dávid, Dr. Szabó Krisztián

Absztrakt:

A kétéltűek populációi világszerte drasztikusan zsugorodnak vagy eltűnnek. A közismert környezeti okok mellett, ebben fertőző betegségek, köztük vírusok is, jelentős szerepet játszanak. A ranavírusok súlyos lokális elhullásokat okozhatnak, s Magyarországon előforduló kétéltűekben is kimutatták már jelenlétüket, igaz csupán az érzékeny qPCR módszerrel, így genetikai jellemzésük sem történt meg. Az elmúlt évtizedben két új béka herpeszvírust írtak le Nyugat-Európa több országából is, s e fertőzésekre utaló tüneteket már itthon is jelentettek, ám a kórokozó(k) kimutatása és karakterizálása nélkül. Kétéltűekből mindössze néhány fajban detektáltak eddig részleges cirkovírus szekvenciát, két esetben bizonyítottan a gazda genomjába beépült maradványokat, ún. endogén vírusokat, de ez idáig még nem írtak le belőlük teljes genommal rendelkező, fertőző (exogén) cirkovírust. Vizsgálatunk célja volt, hogy frissen gyűjtött tampon mintákból a fenti vírus csoportok képviselőit mutassuk ki polimeráz láncreakció (PCR) segítségével és genetikailag jellemezzük ezeket. Mintáinkat 14 Budapest közeli élőhelyről gyűjtöttük, összesen 56 barna varangy (Bufo bufo) és 48 erdei béka (Rana dalmatina) egyedből. A ranavírus esetében a fő kapszid fehérje génjét, a herpeszvírusok esetében a DNS-polimeráz gént, a cirkovírus esetében a rep gént célozta a szűréshez használt PCR. További primereket terveztem, hogy ranid herpeszvírus egy variábilisabbnak vélt génjét (ORF97) teljes hosszában feltárjuk valamint hogy a cirkovírus teljes genomját megismerjük (vagy endogén voltát igazoljuk). Ranavírust két erdei béka egyedből sikerült kimutatni, karakterizálásuk folyamatban van. Ranid herpeszvírus-3 jelenlétét négy különböző élőhelyről származó 12 erdei békában igazoltuk. A részleges DNS-polimeráz gén (1200bp) és a teljes ORF 97 gén (3750bp) szekvenciák alapján e hazai törzs 3-4 %-ban tér el a nyugat-európai prototípustól. Bufonid herpeszvírust két élőhelyről, 1-1 varangyból detektáltunk, ezek rövid szekvenciája azonos volt a svájci prototípuséval. Varangy mintákat vizsgálva 10 állatból sikerült kimutatni részleges cirkovírus rep gén jelenlétét, további 13 esetben is specifikus méretű terméket kaptunk a szűréshez használt erősen degenerált primerekkel, ám ezekből még nem tudtunk értékelhető szekvenciát nyerni, míg a fennmaradó egyedeknél nem eredményezett terméket a PCR. A varangy cirkovírus esetén saját primereinkkel igazoltuk annak endogén voltát, és azonosítottuk az integráció helyét a gazda kromoszómán. Erdei béka minták esetén, egy galamb cirkovírus szennyeződés kimutatásán túl, egy eddig ismeretlen ciklovírus felfedezését is eredményezte ez a PCR vizsgálat.



Előadások listája