Szekciók

Az antimikrobiális rezisztencia élelmiszerláncon belüli terjedése One Health szempontból kiemelt jelentőségű. A közétkeztetésben használt, többször alkalmazott ételszállító edények nehezen tisztítható szerkezeti részei baktériumok tartós fennmaradását tehetik lehetővé. Jelen kutatás során a 2025 őszén, 17 intézményt ellátó három főzőkonyha rendszeréből, 53 különálló badella túlnyomásszabályozó egységéből izolált Escherichia coli törzset vizsgáltuk.

A fenotípusos érzékenységet leves mikrodilúciós módszerrel, minimális gátló koncentráció (MIC) meghatározással vizsgáltuk, majd valamennyi izolátum teljesgenom-szekvenálását Oxford Nanopore MinION platformon végeztük el és integrált bioinformatikai elemzését hajtottuk végre.

Klinikai rezisztenciát csak florfenikollal szemben észleltünk két izolátumban (3,8%). Négy törzs cefotaxim MIC-értéke meghaladta az epidemiológiai határértéket (ECOFF), de a klinikai töréspont alatt maradt. Legalább az egyik cefalosporin–klavulánsav párban tíz izolátum mutatott inhibitor-szinergia jelet, klasszikus kiterjedt spektrumú β-laktamáz (ESBL) gének nélkül. A genomok kiváló minőségűek voltak, a BUSCO-val becsült teljesség valamennyi genomban 99,1%, a CheckM-mel becsült átlagos teljesség pedig 99,88% volt. A populáció 11 meghatározható MLST-típust és 15 szerotípust tartalmazott; ezek közül az ST5295/O71:H12 vonal dominált. A pángenom 10 294 génklaszterből állt, amelynek 67%-a változó génállomány volt. A CARD-alapú elemzés 46 különböző rezisztencia-asszociált gént azonosított, de ezek többsége természetes efflux- és regulációs gén volt; szerzett ESBL-, karbapenemáz-, mcr-, qnr-, tet-, sul- vagy floR-gént nem mutattunk ki. A virulómot főként kolonizációs, biofilm- és vasfelvételi modulok jellemezték, klasszikus patotípus vagy Shiga-toxin nélkül. Genomonként átlagosan 8,8 profág-régió volt jelen.

Az új mintakészletben leíró összevetésben alacsonyabb fenotípusos rezisztenciaterhelést figyeltünk meg, mint a korábbi vizsgálati körben; ugyanakkor a badellák nehezen hozzáférhető szerkezeti részeiből ismét genetikailag változatos E. coli törzseket izoláltunk. A célzott higiéniai monitoring és az integrált fenotípusos–genomikai vizsgálat ezért továbbra is indokolt.