Szekciók

A Sedoreoviridae családba tartozó rotavírusok emberekben és állatokban egyaránt az akut gastroenteritis jelentős kórokozói. A Rotavirus nemzetségben belül kilenc különböző faj különíthető el, amelyeket az A-J betűjelölések alapján azonosítanak. A vírus genomját 11 kettős szálú RNS -szegmens alkotja, amely hat strukturális (VP) és öt vagy hat nem strukturális (NSP) fehérjét kódol. A törzseket G, illetve P genotípusok sorolják be a VP4 és a VP7 szekvenciák alapján. A rotavirus H (RVH) jelenlétét számos ország sertésállományaiban igazolták, klinikai jelentősége azonban továbbra sem teljesen tisztázott. Vizsgálatunk célja az RVH előfordulásának felmérése magyarországi sertésállományokból származó mintákban, valamint a kimutatott törzsek genetikai változatosságának vizsgálata volt.

Összesen 77 bélsártamponmintát vizsgáltunk, amelyek 16, hasmenéses megbetegedéssel érintett sertésállományból származtak. A mintákat Nanopore újgenerációs szekvenálással elemeztük, a szekvenciaadatok feldolgozását és elemzését Geneious Prime szoftverrel végeztük. A genetikai jellemzés a VP7 és VP4 génekre terjedt ki. A filogenetikai fákat MEGA X programmal, maximum likelihood módszer alkalmazásával, 1000 bootstrap ismétléssel készítettük el.

A RVH-t a vizsgált minták 21%-ában és a mintavételbe bevont telepek 38%-án mutattunk ki. Eredményeink a vírus jelenlétét földrajzilag elkülönülő magyarországi sertésállományokban igazolták. Három RVH-törzs VP7 és VP4 génjének szekvenciáját határoztuk meg, amelyek alapján G18P[12], G4P[12] és G18P[10] genotípus-kombinációkat azonosítottunk. A filogenetikai vizsgálatok szerint a hazai törzsek legközelebbi rokonai korábban leírt európai, elsősorban olaszországi RVH-törzsek voltak. A magyar szekvenciák ugyanakkor az ismert genotípusokon belül elkülönülő csoportokat is alkottak.

Eredményeink elsőként szolgáltatnak genetikai adatokat a hazai sertésállományokban cirkuláló RVH-törzsekről. Az RVH klinikai jelentőségének tisztázásához további kutatások szükségesek. A jövőbeni, teljes genomra kiterjedő elemzések a törzsek részletesebb jellemzését, valamint a lehetséges reasszortációs és rekombinációs események vizsgálatát is elősegíthetik.