Zoológus/Biológus szekció

A denevérek fontos szerepet játszanak a különféle víruscsaládok természetes rezervoárjaiként, amelyek közül sok más emlősöket, így az embert is megfertőzheti, mely járványok kialakulásához vezethet. A WHO betegség prioritási listáján is több denevér eredetű vírus által okozott megbetegedés található (pl. COVID-19, Nipah, Ebola), de szerepel rajta az „X betegség” is, mely a természetben előforduló, de még nem ismert, potenciálisan humán járványokat okozni képes betegségeket jelöli. Célunk olyan új vírusok felfedezése és genetikai jellemzése volt vietnami denevérmintákból, melyek közelebb vihetnek a virális diverzitás megismeréséhez, esetleg az ellenük való hatékony védekezés kidolgozásához.

A metagenomika módszertára hatékony eszköz az új vírusok felfedezésére, különösen mivel kedvező esetben az Illumina szekvenálásból származó rövid olvasatokból gyakran összeállítható a teljes vírusgenom is. Vizsgálatunkban 2017-ben, Vietnámban gyűjtött denevér guanó mintákból származó szekvenciákat elemeztünk. Denevér példányonként lettek a minták szekvenálva, ami lehetővé tette az eredmények egyedekhez kötését. Összesen 55 egyedtől származó mintát vontunk a vizsgálatokba és számos víruscsaládból mutattunk ki új vírusokat. A mintákban koronavírusokat, adenovírusokat, circovírusokat, hepatitis B vírust, hepatitis E vírusokat, herpeszvírusokat, picornavírusokat, genomovírusokat és parvovírusokat találtunk.

Két víruscsoportot vizsgáltunk meg alaposabban. Koronavírusok közül 7-et találtunk, melyek többsége alfakoronavírusnak bizonyult, de volt közülük egy sarbecovírus is. A sarbecovírus (ezek közé tartozik a SARS-CoV-1 és -2, valamint a MERS) genom alig 60%-át sikerült az Illumina readekből összeállítani, ezért amplikon-alapú Nanopore szekvenálással határoztuk meg a genom hiányzó részeit. Az alfakoronavírusok közül az egyik a sertések között járványos hasmenést és pusztulást okozó egyik koronavírushoz közeli vírust is találtunk. Két Hepatitis E vírust is találtunk, melyek közül az egyiknek a teljes, a másiknak közel teljes genomját sikerült meghatároznunk. A Hepatitis E vírusok évente több mint 20 millió embert fertőznek meg világszerte, több tízezer halálesetért felelősek. Csak kevés denevér eredetű Hepevírus ismert, valószínűleg zoonotikus potenciállal bírnak. Eredményeink valószínűsítik, hogy a Hepevírusok elterjedtebbek a denevérekben, mint azt eddig gondoltuk és viszonylag fajspecifikusak is lehetnek. Eredményeink hozzájárulnak a koronavírusok és Hepevírusok diverzitásának jobb megértéséhez és újabb példái annak, hogy még rengeteg felfedezni való vírus kering a denevérekben.