Szekciók

A coronavírusok (CoV-ok) gyors evolúciója, széleskörű elterjedése és légúti fertőzésekben betöltött szerepe indokolttá teszi azok folyamatos figyelemmel követését. Az elmúlt évtizedekben számos, állatokat és embert érintő, köztük zoonotikus fertőzést okozó CoV-t dokumentáltak, köztük a súlyos akut légúti tünetegyüttest okozó CoV-t (severe acute respiratory syndrome CoV, SARS-CoV), SARS-CoV-2-t, és a middle east respiratory CoV-t (MERS-CoV).

A hazánkban egyre nagyobb népszerűségnek örvendő, újonnan megjelenő haszonállatok, az alpakák (Vicugna pacos) esetében kevés adat áll rendelkezésre az állományokban cirkuláló vírusokról. A tevefélék családjában korábban mind a MERS-CoV-t, mind a szarvasmarha CoV-t (bovine CoV, BoCoV) leírták. Az egypúpú tevét (Camelus dromedarius) a Közel-Keleten történt 2012-es kitörés óta a MERS-CoV rezervoár fajaként, az emberi fertőzések közvetlen okozójaként tartják számon. A BoCoV jellemzően nagytestű kérődzőket fertőz, a szavasmarhák téli dizentériájának egyik kulcs kórokozója. A vírus genomi szinten nagy hasonlóságot mutat, valamint feltehetően közös őssel rendelkezik, ezért taxonómiailag egy kvázispecieszt alkot a humán OC43 vírussal, a lovak CoV-ával, kutya légúti CoV-sal, és a malacok agy- és gerincvelő gyulladását okozó hemagglutináló vírussal.

A tanulmány során 118 db Magyarországon gyűjtött alpaka nazális és rektális tampon minta szűrését végeztük el egy újonnan tervezett CoV specifikus nested PCR alapú, széles-spektrumú detektáló rendszerrel, amely virtuálisan valamennyi CoV kimutatására alkalmas. A minták közül kilencben a PCR mellett Sanger szekvenálással is igazoltunk CoV szekvenciák jelenlétét, amelyek közül nyolc OC43/BoCoV, valamint egy SARS-CoV-2 referencia szekvenciákkal csoportosult az elemzések során.

Az amplifikált, konzervatív CoV genomrégió (RNS-függő RNS-polymeráz) alapján a nyolc OC43/BoCoV pozitív minta esetében a vírus pontos meghatározása nem lehetséges, mivel a két vírus ezen genomi régiója megegyezik. Szakirodalmi adatok alapján a BoCoV-t korábban is megtalálták alpakákban, míg az OC43 elsősorban embereket érintő enyhe felső légúti megbetegedést okoz. Jövőbeli terveink közt szerepel a vírusok pontos azonosítása és a teljes genomszekvencia vizsgálata.