Tudományos Diákkör    
 
 
Felhívás
Fényképalbumok
Sajtómegjelenés
» Archívum
2025. TDK
2024. TDK
2023. TDK
2022. TDK
2021. TDK
2020. TDK
2019. TDK
2018. TDK
2017. TDK
2016. TDK
2015. OTDK
2015. TDK
2014. TDK
2013. TDK
2013. Támop
2013. OTKD
2012. TDK
2012. Támop
2011. TDK
2010. TDK
2009. TDK
2009. OTDK
2008. TDK
2007. TDK
2006. TDK
2005. TDK
2004. TDK
2003. TDK
2002. TDK
Szabályzat
Home » Archívum

Archívum

Egyszerüsitett és idöhatékony DNS-kinyerési protokoll kidolgozása agancsból
Kalina, Borbala V. évfolyam
Állatorvostudományi Egyetem, Állattenyésztési, Takarmányozástani és Laborállat-tudományi Tanszék
Témavezetők: Dr. Zenke Petra Zsuzsanna, Lőrincz Eszter Éva

Absztrakt:

A szarvasfélék (Cervidae) agancsa egyedülállóan gyorsan növekvő, évente megújuló csontszövet, amely kiváló forrása lehet a genetikai vizsgálatoknak. Az agancsból kinyert DNS nemcsak populációgenetikai és természetvédelmi kutatásokban hasznos, hanem igazságügyi vizsgálatokban is értékes bizonyíték lehet. Az eddig leírt kinyerési módszerek közül egyesek azonban speciális laborfelszereltséget, vagy hosszú időt igényelnek, mások nem tartalmazzák a szükséges információkat a reprodukálhatóság vagy a kinyert DNS mennyiségére és tisztaságára vonatkozóan, illetve korlátokkal rendelkezhetnek a felhasznált mintatípus és a célzott genomszakasz tekintetében. Kutatásunk célja ezért egy olyan módosított protokoll kidolgozása volt, amely egyszerűbb és gyorsabb, ugyanakkor megbízhatóan biztosít megfelelő mennyiségű és minőségű DNS-t széleskörű genetikai vizsgálatokhoz.

Őz, gím- és dámszarvas egyedek összesen 30 darab agancsmintáját vizsgáltuk, (fajonként 10-10 db) melyekből a felületi tisztítás után alacsony fordulatszámú fúrással vizsgálati mintát biztosítottunk. Az agancsminták mechanikus roncsolása után négy órás emésztés és dekalcifikálás, majd szerves oldószerrel (fenol–kloroform–izoamil-alkohol) történő tisztítás és végül ultracentrifugálás révén történő bekoncentrálás következett. A kivont DNS mennyiségét és minőségét agaróz gélelektroforézissel, Qubit fluorometriával és Nanodrop spektrofotometriával ellenőriztük. Az eddig leírt technikákhoz képest több pontban is módosított módszerünk használhatóságának igazolására fajspecifikus, nukleáris mikroszatellitákat sokszorosító multiplex PCR vizsgálatokat végeztünk.

A vizsgált paraméterek alapján a három szarvasféle mintáinak eredmények között nem mutatkozott jelentős különbség. A kinyert genetikai anyag integritásának, koncentrációjának és tisztaságának felmérésére irányuló vizsgálatok igazolták, hogy a minták döntő többsége megfelelő mennyiségű és minőségű DNS-t adott a további vizsgálatokhoz. Ugyanakkor a szuboptimális mennyiségi, vagy tisztasági értékekkel rendelkező minták PCR vizsgálata is teljes genetikai profilt eredményezett, ami alátámasztja a kidolgozott protokoll alkalmazhatóságát, akár sejtmagi vizsgálatokra is.

Az eredmények alapján a kidolgozott eljárás kis mennyiségű és erősen mineralizált mintából is megbízhatóan biztosít megfelelő mennyiségű és minőségű DNS-t további genetikai vizsgálatokhoz is. A protokoll bár fokozott körültekintéssel kezelendő (egészségre ártalmas) vegyszert (fenol) tartalmaz, a hagyományosan csontmalmot és folyékony nitrogént igénylő módszerekkel egyenértékű hozamot és tisztaságot biztosít egyszerűbb és költséghatékony módon. További tesztelésekhez szeretnénk a vizsgálatokba más kalcifikált mintatípusokat (pl. koponya trófeák), illetve más szarvasfajok különböző korú agancsmintáit is bevonni.



Előadások listája